سعیده قیاسوند

اکتریEscherichia coliیک باکتری گرم منفی، دومین باکتری از نظر فراوانی در روده، وشاخص اصلی آلودگی آب شهری، شایع ترین عامل عفونت ادراری و یکی از عوامل اصلی مسمومیت غذایی واسهال میباشد. مقاومت دارویی این باکتری به انتی بیوتیک ها به عنوان یک چالش جهانی مطرح می گردد .به فرایند انتقال ماده ژنتیکی در مسیری غیر از انتقال ژن ها به صورت رابطه ی والد- فرزندی انتقال افقی ژن HGT گفته می شود.این فرایند می تواند در روی عملکرد ژنها از جمله ژنهای مقاوم به انتی بیوتیک هنگامی که در نزدیکی محل ورود ژن به ژنوم میزبان قرار گرفته تغییر ایجاد کنند. ایجادمقاومت بین باکتری E. Coliبیشتر از طریـق ژنهای متحـرک انجـام مـیشــود. امروزه از ابزراهای بیوانفورماتیکی برای فهم و ردیابی ژنهای انتقال یافته با مکانیزیم انتقال افقی استفاده میشود. در این تحقیق با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی مانند PredictBias، ACLAME، Mobil Genetic Elements (MGEs) و PAI-IDAوAlien_Hunter به بررسی برخی ژنهای دخیل در مقاومت به انتی بیوتیک در باکتری E. Coli پرداخته شد. نتایج بیوانفورماتیکی همراه با نتایج ازمایشگاهی تست MIC بر روی نمونه ها نشان داد: که بین 26 تا 32 ژن در تمام نرم افزارها شناسایی گردید. بیشترژنهای شناسایی شده درصد باز های GC بالای 50 درصد را نشان میدهند. ژنهایی مانند put P با 178 توالی ، blaCMY ژنهای بر روی پلاسمید با 62 ژن ، BlaTEM 43 ، و aac-6 با66 توالی در سایت PredictBias و همچنین در سایت ACLAME , mobC ، mobA ، mobBو خانواده ژنی rep که بیشترین احتمال انتقال افقی در بین سویه های بیماری زایی را دارا هستند بیشترین مقاومت را نیز در تست های ازمایشگاهی که حامل ژنهای مقاوم blaSHV و blaCHV بر روی پلاسمید blaCMY را نشان میدهد.