1403/08/24
سعیده قیاسوند

سعیده قیاسوند

مرتبه علمی: استادیار
ارکید:
تحصیلات: دکترای تخصصی
اسکاپوس:
دانشکده: دانشکده علوم پایه
نشانی:
تلفن: 09120929781

مشخصات پژوهش

عنوان
Bioinformatic Analysis of Horizontal Transmission of Genes Related to Antibiotic Resistance Genes in Escherichia coli
نوع پژوهش
مقاله چاپ شده
کلیدواژه‌ها
انتقال افقی ژن، بیوانفورماتیک، MIC ،مقاومت آنتی بیوتیکی، اشریشیا کلی
سال 1398
مجله زيست فناوري
شناسه DOI
پژوهشگران سعیده قیاسوند

چکیده

coli Escherichia یک باکتری گرم منفی، دومین باکتری از نظر فراوانی در روده و شایعترین عامل عفونت ادراری و از عوامل اصلی مسمومیت غذایی و اسهال است. همچنین بهعنوان شاخص اصلی آلودگی آب شهری اهمیت ویژهای دارد. مقاومت دارویی این باکتری به آنتیبیوتیکها بهعنوان یک چالش جهانی مطرح میشود. به فرآیند انتقال ماده ژنتیکی در مسیری غیر از انتقال ژنها بهصورت رابطه والد- فرزندی انتقال افقی ژن (HGT (گفته میشود. این فرآیند میتواند روی عملکرد ژنها از جمله ژنهای ایجادکننده مقاومت به آنتیبیوتیکها تغییر ایجاد کند. ایجاد مقاومت در باکتری coli. E میتواند از طریق ژنهای متحرک به گونههای دیگر باکتریها هم انتقال پیدا کند. امروزه از ابزارهای بیوانفورماتیکی برای فهم و ردیابی ژنهای انتقالیافته با مکانیزم انتقال افقی استفاده میشود. در این مطالعه با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی مانند PredictBias، Alien‐ و PAI‐IDA ،Mobil Genetic Elements (MGEs) ،ACLAME Hunter به بررسی برخی ژنهای دخیل در مقاومت به آنتیبیوتیک در باکتری coli. E پرداخته شد. نتایج بررسیهای بیوانفورماتیکی و روش MIC انتقال افقی ژنهای مقاومت را نشان داد. 26 ژن از 32 ژن در کلیه نرمافزارها انتقال را نشان دادند. بیشتر ژنهای شناساییشده دارای درصد بازهای GC بالای 50 %بودند. ژنهایی مانند P put با 178 توالی، blaCMY با حدود62 توالی، BlaTEM با 43 توالی و 6‐aac با 66 توالی در سایتهای PredictBias و ACLAME به دست آمدند. mobC ،mobA و mobB و خانواده ژنی rep بیشترین احتمال انتقال افقی را بین سویههای بیماریزا نشان دادند. بیشترین مقاومت در تستهای آزمایشگاهی را ژنهای blaSHV و blaCHV روی پلاسمید blaCMY نشان دادند.