حدیث طوافی

با‌توجه به‌اینکه پروتئین‌ها، مولکول‌های عملکردی سلول‌های زنده می‌باشند، داشتن آگاهی از نحوه‌ی عملکرد آن‌ها می‌تواند موثر باشد. از جمله عوامل مهم و موثر در عملکرد پروتئین‌ها، ساختار سه بعدی آن‌ها می‌باشد. آنزیم گلوتاتیون اس ترانسفراز، یکی از پروتئین‌های موجود در سلول‌های زنده می‌باشد که در عمل انتقال دادن و سم زدایی ترکیبات بیگانه زیست شرکت دارد. در این مطالعه ساختار 3 بعدی پروتئین گلوتاتیون اس ترانسفراز جدا شده از شیگلا دیسانتری که به روش تجربی تعیین ساختار نشده است با کمک همترازی با توالی‌های اشریشیا کلای (استرین کا 12) با برنامه ی Swiss model شبیه سازی شد. نتیجه‌ی همترازی انجام شده نشان داد که ژن گلوتاتیون اس ترانسفراز در مقایسه با ژن انسانی 84% شباهت را دارد. هچنین نتایج نشان دادند که لوسین، اسید آمینه سازنده‌ی این پروتئین بود که نسبت به سایر اسید آمینه‌های دیگر، میزان بیشتری از ترکیب پروتئین را به خود اختصاص داده بود. به منظور بررسی کیفیت مدلسازی، RMS محاسبه شد، که در مدل مورد نظر 47/0 آنگستروم بود که این مقدار کمتر از 1 بود که نشان دهنده مناسب بودن مدل طراحی شده می باشد. با تعیین و پیش بینی ساختار و مدل سازی آنزیم‌ها می‌توان به بررسی برهمکنش‌های بین دنباله‌ها وسوبسترای آن‌ها پرداخت و در زمینه‌ی ساخت دارو‌ها و واکسن‌ها از روش-های مدل سازی بیوانفورماتیکی استفاده موثر کرد.