واژه ی میکروبیولوژی از سه بخش میکرو به معنی کوچک، بیوس به معنای زندگی و لوگوس به معنای دانش و عقل درست شده است. میکروبیولوژی خود دارای زیرشاخه های گوناگونی است که از انها می توان مرفولوژی (ریخت شناسی)، فیزیولوژی ( ساختمان و متابولیسم)، پاتو لوژی (بیماری زابودن یا نبودن)، اکولوژی (بوم شناسی)، ژنتیک و گروهبندی سیستماتیک هریک از گروه های میکروبی را نام برد.