ریزجانداران سودمند در خاک از راههای گوناگونی می توانند بر رشد گیاهان موثر باشند. برخی از ریزجانداران با ترشح انزیم ها، ترشح هورمون ها، ترشح مواد آنتی بیوتیک، ترشح مواد پیچیده، ترشح اسیدهای آلی، ترشح هورمون ها و مواد محرک رشد ، می توانند در انحلال و معدنی شدن عناصر مغذی برای گیاه موثر باشند.