مدل پنهان مارکف یک مدل مارکف است که در آن سیستم مدل شده بصورت یک فرآیند مارکف یا حالت پنهان فرض می شود. این مدل ابزاری در پیش بینی مدل های تصادفی بسیار تواناست. اخیرا در زمینه های پزشکی برای پیش بینی، روند پیشرفت بیماری هاو کشف حالات انواع بیماری و... مورد مطالعه و استفاده قرار گرفته است. در این مقاله قصد داریم با کمک مدل پنهان مارکف که به عنوان ابزار قدرتمندی در مدل بندی فرآیند های تصادفی محسوب می شود به مدلسازی شبکه تنظیم ژن داده های سرطان سینه پرداخته و احتمال ژن های تنظیمی ژن هدف را بدست آوریم.
