در اکوسیستمهای آبی، رسوبات بهتر از ستون آب نشانگر وضعیت محیط و منبع اصلی برای ذخیره ی آلایندهها می باشد. در مطالعه حاضر برای بررسی آلودگی فلزات سنگین رودخانه قرهسو، از رسوبات آن نمونهبرداری و پس از هضم اسیدی نمونهها، میزان عناصر با دستگاه جذب اتمی مورد سنجش قرار گرفت و با استفاده از شاخص ارزیابی ریسک اکولوژیک، شاخص ژئوشیمیایی مولر، پهنهبندی و تحلیلهای آماری وضعیت آلودگی فلزات سنگین در رودخانه قرهسو ارزیابی گردید. نتایج شاخص مولر نشان داد رسوبات رودخانه از نظر آلودگی به عنصرهای روی، سرب و کروم در طبقه غیر آلوده و از نظر آلودگی به فلز مس با درجه آلودگی یک، در طبقه از غیر آلوده تا آلودگی متوسط قرار میگیرد. همچنین رودخانه از نظر آلودگی فلزات سنگین در طبقه ریسک اکولوژیکی در خور ملاحظه قرار و احتمال آلودگی به مس و سرب در منطقه وجود دارد. در نهایت با توجه به نتایج آزمون دانکن و طبق نقشه پهنهبندی با درونیابی لایهها با دو روش کوکریجینگ و کریجینگ و تحلیل نقاط داغ هر کدام از عناصر مورد بررسی، بخش شرقی با عمدهترین کاربریهای صنعتی، کشاورزی و شهری بهعنوان آلودهترین قسمت مشخص گردید که بهمنظور کنترل و جلوگیری از آلودگی بیشتر به تمهیدات کارامدی نیاز دارد.