نقش اکوسیستم های آبی به ویژه تالاب ها در طبیعت و زندگی بشر بر کسی پوشیده نیست . امروزه رشد جمعیت و افزایش بی رویه شهرها و در پی آن توسعه صنایع در تمامی نقاط کره زمین مشهود است. آلودگی اکوسیستم های آبی به فلزات سنگین می تواند از طریق بررسی آب، رسوب و موجودات زنده مورد تائید قرار گیرد. این مطالعه به بررسی آلودگی فلزات سنگین مس و نیکل در رسوبات اطراف حوضه آبگیر تالاب میقان اراک به کمک شاخص های کیفی آلودگی می پردازد. نتایج بررسی کیفیت رسوب نشان داد آلودگی این عناصر در ایستگاه های مختلف در سه سطح قابل توجه، متوسط و پایین قرار دارد. با توجه به این مطالعه، می توان اذعان نمود که شرایط حاکم بر منطقه از جمله ورود فاضلاب شهری، روستایی و صنعتی، زه آب اراضی کشاورزی، استقرار شرکت معدنی املاح ایران در مجاور تالاب، استقرار فرودگاه اراک در نزدیکی تالاب و نزدیکی تصفیه خانه شهر اراک به این اکوسیستم، در کنار شرایط طبیعی حاکم بر منطقه، در بلند مدت سبب تجمع بیش از حد استاندارد عناصر سنگین در رسوبات شده و نیازمند کنترل و مدیریت زیست محیطی است.