بررسی وضعیت متون آموزشی و آسیبشناسی کتابهای درسی در راستای اصلاح، تکمیل، روزآمد و کارآمد کردن آنها، یکی از اقدامات لازم و متداول در نظامهای آموزشی است. در بررسی و آسیبشناسی متون درسی دانش فلسفه در حوزه علمیه قم، با روش تحلیل مضمونی دادههای گردآمده از طریق مصاحبه و کتابخانهای، می‌توان آسیبهای متعددی را یافت که به دو بخش آسیبهای عمومی و آسیبهای اختصاصی قابل تفکیکاند. در بخش آسیبهای عمومی، موارد فراونی از آسیبها ناظر به اهداف آموزشی، روش آموزشی، محتوای آموزشی، شکل و ظاهر متن آموزشی، ساختار متن آموزشی و جنبههای روانشناختی، قابل مشاهدهاند. در بخش آسیبهای اختصاصی نیز موارد متعددی از اشکالات به چشم میخورند؛ همچون: فقدان متنی مناسب به‌عنوان مدخل و درآمد برای آغاز آموزش فلسفه، انتزاعی و غیرکاربردی بودن، بیتوجهی به فلسفههای مضاف، عدم توجه به آموزش منتقدانه مکاتب و نظامهای فلسفی غربی، نپرداختن به مباحث معرفتشناسی، نقصان برخی سرفصلهای مهم در برخی کتابهای درسی، گرفتار بودن بخشهایی از مطالب متون فلسفه در بند برخی مباحث منسوخ‌شده قدیمی، اختلاف در ترتیب مباحث، عدم توجه به تاریخ فلسفه در طرح مباحث، تعارض برخی مباحث فلسفی با آموزههای دینی و اختلاط مسائل فلسفی.
