مشخصات پژوهش

عنوان	تشخیص جوامع در برهمکنش های پروتئین-پروتئین با ترکیب خوشه بند k-means و الگوریتم بهینه سازی شاهین هریس
نوع پژوهش	مقاله ارائه شده
کلیدواژه‌ها	الگوریتم فراابتکاری شاهین، تشخیص جوامع، تعاملات پروتئین-پروتئین، خوشه بند ،k-meansیادگیری ماشین
چکیده	شناسایی سطح ارتباط بین پروتئینها در شناخت بیماریهای ناشناخته و طراحی داروها نقش اساسی دارد. این فرآیند در شبکههای تعاملی پروتئین- پروتئین صورت میگیرد که نوعی از شبکههای پیچیده است که در آن گرهها پروتئینها و یالها تعاملات بین پروتئین میباشند. یکی از روشهای کارا در این حیطه استفاده از روشهای مبتنیبر یادگیری غیرنظارتی میباشد و اجتماع یابی که اساس آن بررسی سطح تعامل بین اجزای هر جامعه به عنوان یال گرهها است و به نسبت خوشه بندی که بر بررسی ویژگی گرهها متمرکز است مزیت هایی دارد، به عنوان روش مورد بررسی انتخاب شده است. در این پژوهش ابتدا مدلسازی سطح تعامل پروتئین P53با سایر پروتئین ها انجام شده و سپس از طریق اجتماع یابی بوسیلهی ترکیب الگوریتم فراابتکاری شاهین هریس و خوشه بند k-meansجوامع مورد نظر تشخیص داده میشوند. اهمیت تشخیص سطح تعامل پروتئین p53با سایرین در این است که این پروتئین به عنوان سرکوب گر تومورهای سرطانی شناخته شده و از ابتلا به این بیماری در بدن جلوگیری می کند. روش پیشنهادی با میزان NMIبرابر با 0.82در مقابل خوشه بند k-meansکه 0.39بود دقت به مراتب بهتری را از خود نشان داد
پژوهشگران	داور گیوکی (نفر اول)